1 Februari 2019. Untuk mendukung Program Magister menuju Doktor Sarjana Unggul (PMDSU), Kemenristek Dikti memberikan beasiswa untuk Kegiatan Peningkatan Kualitas Publikasi Internasional (PKPI) bagi mahasiswa penerima beasiswa BPP-DN untuk melakukan riset dengan mitra universitas di luar negeri dalam rangka meningkatkan publikasi internasional. Melalui beasiswa inilah, Windi Mose, mahasiswa Prodi Doktor Biologi Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada (UGM) melakukan penelitian selama enam bulan di School of Life Sciences, University of Warwick (UW), United Kingdom dibawah bimbingan PI (Principal Investigator) Prof. Jose Gutierrez-Marcos dan Dr. Endang Semiarti, M.S., M.Sc. selaku PI di UGM.
Selama di UW, Windi meneliti tentang profil transkriptomik pada tahapan induksi embriogenesis somatik tanaman anggrek transgenik Phalaenopsis amabilis yang membawa gen kunci embriogenesis dari tanaman model Arabidopsis, AtRKD4. Penelitian ini dilakukan menggunakan teknologi Whole Transcriptome Shotgun Sequencing (WTSS) atau biasa disebut RNA sequencing (RNA-seq).
RNA-seq merupakan teknologi yang revolusioner bagi studi transkriptomik. Melalui RNA-seq, peneliti dapat menganalisis populasi RNA yang berbeda, termasuk total RNA dan small RNA (miRNA dan tRNA), modifikasi pasca transkripsi, fusi gen, mutasi dan perubahan ekspresi gen yang terjadi seiring waktu atau perbedaan ekspresi gen pada kelompok atau perlakuan yang berbeda. Namun keterbatasan alat sekuensing seperti Illumina dan biaya analisis per sampel yang cukup besar membuat penelitian RNA-seq masih jarang dilakukan di Indonesia.
Melalui teknologi RNA-seq, kerjasama penelitian UW-UGM dapat menentukan diferensial ekspresi gen selama induksi embriogenesis somatik tanaman anggrek P. amabilis yang diharapkan kedepannya dapat dikloning dan dikarakterisasi sehingga dapat digunakan sebagai dasar molekular perbanyakan dan konservasi bunga nasional kebanggaan Indonesia ini. Selain itu, Windi juga melakukan kloning dan transformasi gen homolog RKD dari anggrek Phalaenopsis ke tanaman Arabidopsis untuk mengetahui peran faktor transkripsi RKD anggrek terhadap proses embriogenesis somatik.
Hasil penelitian selama di UW ini akan dipublikasikan pada jurnal internasional sebagai persyaratan kelulusan Windi selaku mahasiswa PMDSU di Pascasarjana Fakultas Biologi UGM.
