Demi mendukung visi misi dan mencapai profil lulusan maka dirumuskan kompetensi lulusan Prodi PKKH UGM.
Lulusan Prodi PKKH memiliki kemampuan untuk melakukan pekerjaan perencanaan kurasi, pengumpulan dan pendataan koleksi, analisis koleksi, dan perawatan koleksi keanekaragaman hayati tropika Indonesia. Kompetensi Lulusan Prodi PKKH tersebut dijabarkan sebagai berikut:
