Sebagai organisasi yang didirikan di Yogyakarta 7 tahun lalu tepatnya 22 September 2011, KOBI bertujuan untuk berperan aktif dalam pengembangan pendidikan tinggi biologi dalam penguasaan keanekaragaman hayati, untuk pemanfaatan sumber daya alam hayati (bioresources) secara optimal dan berkelanjutan bagi kesejahteraan umat manusia dan kelestarian lingkungan. Dalam mengejawantahkan tujuan tersebut, KOBI memiliki misi yaitu:
1. Menghimpun lembaga-lembaga Pendidikan Tinggi dibidang Biologi baik pemerintah maupun swasta.
2. Melakukan komunikasi, menjalin kerjasama dan bersinergi dengan lembagalembaga yang bergerak dalam bidang biologi dan bidang terkait, baik di dalam maupun di luar negeri.
3. Membantu pemerintah dalam pembangunan berbagai sektor kehidupan yang terkait dengan bidang biolog.
Dalam rangka mengimplementasikan misi utama yaitu menghimpun lembaga-lembaga Pendidikan Tinggi di bidang Biologi, maka pada Kongres KOBI ke-2 ditandatangani nota kesepahaman antara 9 Perhimpunan dan Asosiasi Peneliti dan Program Studi Bidang Biologi. Adapun Nota kesepahaman ini dibuat untuk penguatan riset dasar berbasis megabiodiversitas, pengembangan SDM dan program studi life sciences, kerjasama pengelolaan jurnal, pembenahan kurikulum Pendidikan tinggi, standardisasi kualitas lulusan, kerjasama pembentukan Asosiasi Profesi Biologi dan yang terkait di Indonesia. Nota kesepahaman ini ditandatangani oleh:
- Konsorsium Biologi Indonesia (KOBI)
- Ikatan Program Studi Bioteknologi Indonesia (IPSBI)
- Perhimpunan Mikrobiologi Indonesia (PERMI)
- Konsorsium Bioteknologi Indonesia (KBI)
- Asosiasi Program Studi Pendidikan Biologi (APSPBI)
- Perhimpunan Mikologi Indonesia (Mikoina)
- Fakultas Teknobiologi Universitas Surabaya (FTb-UBAYA)
- Fakultas Kedokteran Universitas Surabaya (FK-UBAYA)
- Fakultas Farmasi Universitas Surabaya (FF-UBAYA)