Pada tanggal 1 Oktober – 30 November 2024, Noor Nailis Sa’adah, mahasiswa Doctoral Fakultas Biologi UGM tahun 2023 Gasal di bawah bimbingan dari Prof. Dr. L. Hartanto Nugroho, M.Agr. (Promotor); Prof. Dr. Yekti Asih Purwestri, M.Si. (co-promotor 1), dan Dr.biol.hom. Nastiti Wijayanti, M.Si. (co-ptomotor 2) melaksanakan kegiatan Internship Penelitian di Nara Institute of Science and Technology (NAIST), Jepang dengan pendanaan dari Iida Scholarship. Program internship penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Plant Secondary Metabolism, Division of Biological Sciences, NAIST di bawah bimbingan langsung dari sensei Prof. Takayuki Tohge. Program ini diinisiasi oleh Prof. Dr. Yekti Asih Purwestri, M.Si. yang merupakan alumni dari NAIST.

Program internship ini berfokus pada penelitian tentang “Metabolomic profiling of Medinilla speciosa fruit at different developmental stages using LCMS”. Beberapa materi yang dipelajari selama internship adalah teori basic tentang metabolomic profiling, ekstraksi sampel, running LCMS, anotasi pada kromatogram dan spektrum hasil LCMS, serta analisis data. Anotasi untargeted metabolite merupakan tantangan utama dalam metabolomic profiling. Data kromatogram dan spektrum diproses menggunakan software Xcalibur versi 4.1.3.1.9 (Thermo Fisher Scientific) dengan 4 tahapan, yaitu 1) Qual Browser (QL), 2) Processing Setup (Pc), 3) Sequence Setup (Sq), 4) Quan Browser (Qn).

Selama internship, mahasiswa juga mengikuti kegiatan regular seperti unit meeting dan seminar meeting yang dilaksanakan setiap minggu. Unit meeting merupakan suatu kegiatan progress report penelitian, setiap mahasiswa mempresentasikan data yang telah diperoleh, serta rencana penelitian yang akan dilaksanakan dalam beberapa minggu ke depan. Sedangkan dalam seminar meeting, mahasiswa mempresentasikan tentang project penelitian dan semua data yang telah diperoleh dihadapan semua anggota Lab dan sensei, disertai dengan sesi tanya jawab dari semua peserta yang hadir. Kegiatan unit dan seminar meeting memberikan banyak insight dan pengetahuan baru, khususnya tentang identifikasi faktor-faktor kunci keragaman metabolit sekunder dan peran regulasi dalam metabolisme sekunder tumbuhan yang memungkinkan rekayasa metabolik senyawa bermanfaat.

Beberapa pelajaran yang bisa diambil dari kegiatan internship di NAIST dalah bagaimana suasana akademik/pembelajaran di Jepang, kedisiplinan, kemandirian, tanggung jawab, serta bagaimana kerja keras  dalam mencapai goal yang diinginkan. Selain kegiatan akademik, selama di Jepang juga dapat menikmati keindahan alam dan budaya di Jepang, khususnya di kota Nara, Osaka dan Kyoto. Kegiatan ini sangat bermanfaat, khususnya untuk mahasiswa karena mendapatkan ilmu baru dan pengalaman yang sangat berharga, serta mendukung program SDGs no 4 (Pendidikan Berkualitas) dan 17 (Kemitraan untuk Mencapai Tujuan). Kegiatan ini diharapkan dapat dilaksanakan secara berkelanjutan dengan peserta dan tujuan kampus yang lebih banyak.

[Noor Nailis Sa’adah, Mahasiswa Program Studi Doktor Biologi UGM Angkatan 2023 Gasal]

Yogyakarta, 15 November 2024 – Research Day 2024 Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada (UGM) resmi ditutup pada tanggal 15 November 2024 dengan meriah dan penuh antusiasme. Penutupan acara yang berlangsung di Gedung B Fakultas Biologi menjadi puncak rangkaian kegiatan dari hari Rabu – Jumat (13 – 15 November 2024) yang mengedepankan inovasi, kolaborasi, dan pengembangan akademik di bidang biologi.

 

 

Acara penutupan Research Day 2024 sebagai agenda Hari Ketiga dimulai dengan Mini Workshop bertemakan metabolomik. Mini Workshop ini menghadirkan PT. Ditek Jaya sebagai mitra yang membahas berbagai aplikasi teknologi dan instrument metabolomik dalam penelitian biologi modern. Diskusi interaktif selama workshop membuka wawasan baru bagi para peserta, baik dari kalangan akademisi, mahasiswa, maupun praktisi biologi. Salah satu sesi yang menarik perhatian dalam Mini Workshop ini adalah praktik langsung atau hands-on penggunaan alat Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) di Laboratorium Biokimia Fakultas Biologi UGM. Sesi ini dirancang untuk memberikan pengalaman praktis kepada peserta dalam memahami cara kerja dan aplikasi teknologi GC-MS, yang merupakan salah satu instrumen penting dalam analisis metabolomik. Dengan pendekatan hands-on, peserta dapat lebih memahami mekanisme kerja alat-alat tersebut, serta cara terbaik untuk mengaplikasikannya dalam riset ilmiah.

Selanjutnya, diadakan juga Biology Exhibition yang menyediakan area pameran instrument dan poster penelitian. Biology Exhibition ini menjadi pusat perhatian dengan menampilkan alat-alat laboratorium canggih serta hasil penelitian terbaru dari mahasiswa dan dosen Fakultas Biologi UGM. Pameran ini menjadi ruang apresiasi atas inovasi dan kerja keras civitas akademika, sekaligus mendorong kolaborasi antarpeneliti.

Sebagai bagian dari agenda strategis, acara ini juga ditutup dengan Monitoring Program Merdeka Belajar Kampus Merdeka (MBKM). Kegiatan monitoring ini mengevaluasi implementasi program MBKM di Fakultas Biologi UGM. Dalam agenda ini, dilakukan presentasi poster dan penilaian peserta MBKM, baik dari Penelitian (Lit-MBKM) maupun Pengabdian kepada Masyarakat (PkM-MBKM). Total terdapat 21 tim PkM-MBKM dan 25 tim Lit-MBKM. Agenda ini dilanjutkan dengan sesi diskusi terbuka. Dengan menghadirkan perwakilan mahasiswa dan dosen pembimbing, sesi ini menjadi refleksi penting untuk meningkatkan kualitas program MBKM ke depan.

Dalam rangkaian Seremonial Penutupan Research Day 2024, dilakukan juga penyerahan kenang-kenangan kepada keenam mitra yang sudah berkolaborasi dengan baik. Acara dilanjutkan dengan penyerahan hadiah kepada Kelompok Studi (KS) terbaik serta kelompok studi yang sudah berkontribusi. Rangkaian Seremonial Penutupan diakhiri dengan pengumuman dan penyerahan hadiah kepada poster terbaik dalam acara Research Day 2024.

Research Day 2024 tidak hanya menjadi ajang berbagi ilmu, tetapi juga mempererat kolaborasi dan semangat inovasi. Fakultas Biologi UGM berharap kegiatan serupa dapat terus dikembangkan untuk menjawab tantangan dunia pendidikan dan penelitian biologi di masa depan. [Penulis: Panitia Research Day]

Yogyakarta, 14 November 2024 – Research Day Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada (UGM) memasuki hari kedua dengan pencapaian luar biasa. Lebih dari 300 peserta berpartisipasi dalam Biology Exhibition yang digelar sebagai bagian dari acara tahunan ini. Pameran yang menampilkan berbagai inovasi, hasil riset, dan instrumen penelitian di bidang biologi tersebut sukses menarik perhatian pengunjung dari kalangan mahasiswa, akademisi, hingga masyarakat umum.

 

 

Acara yang berlangsung di Gedung B Fakultas Biologi UGM ini menampilkan beragam hasil riset dan eksperimen yang mencakup topik-topik seperti fungsional dan perkembangan, biologi lingkungan dan biodiversitas, serta biologi molekuler dan bioteknologi. Setiap booth pameran menghadirkan penjelasan mendalam mengenai berbagai instrumen canggih penelitian, memberikan kesempatan bagi pengunjung untuk berdiskusi langsung dengan ahli.

Selain Biology Exhibition, acara Research Day yang sudah berlangsung selama dua hari ini juga meliputi Mini Workshop dengan menghadirkan berbagai mitra instrumen canggih penelitian. Para peserta dapat memperoleh wawasan tentang terobosan dan teknologi terbaru dalam penelitian biologi. Mini Workshop ini dirancang untuk memberikan pelatihan langsung kepada peserta mengenai berbagai instrumen penelitian canggih yang digunakan dalam riset biologi. Tidak hanya berupa presentasi teori, workshop ini juga memberikan kesempatan bagi peserta untuk melakukan hands-on training dengan alat-alat penelitian canggih.

Berbagai instrumen yang diperkenalkan dalam workshop ini termasuk alat analisis genetik, mikroskopi tingkat lanjut, serta perangkat lunak untuk analisis data biologis dan statistik. Peserta yang terdiri dari mahasiswa, peneliti muda, dan praktisi biologi dapat mengakses alat-alat ini dan mempraktikkan langsung penggunaannya di bawah bimbingan instruktur berpengalaman.

Selain memperkenalkan alat dan teknik riset terbaru, workshop ini bertujuan untuk mengembangkan keterampilan praktis peserta dalam menggunakan teknologi terkini yang penting dalam penelitian biologi. Dengan pendekatan hands-on, peserta dapat lebih memahami mekanisme kerja alat-alat tersebut, serta cara terbaik untuk mengaplikasikannya dalam riset ilmiah.

Research Day Fakultas Biologi UGM diharapkan tidak hanya menjadi ajang pameran hasil riset, tetapi juga sebagai sarana untuk mempererat kolaborasi antara akademisi, industri, dan masyarakat dalam memajukan ilmu pengetahuan, khususnya di bidang biologi. [Penulis: Panitia Research Day]

Biologi Open House dan Pengenalan Topik Riset 2024 (BIOENTRI) adalah acara pengenalan topik riset yang diselenggarakan oleh Fakultas Biologi UGM. Bioentri ini bertujuan untuk mengenalkan topik – topik riset yang diampu oleh para Fakultas Biologi kepada para mahasiswa. Harapannya, melalui pengenalan topik ini mahasiswa mendapatkan inspirasi untuk skripsi dan thesis mereka, dapat bertemu langsung dengan dosen pembimbing yang linear dengan topiknya, dan mendapatkan pemahaman tentang topik riset.

Acara ini dihadiri oleh para mahasiswa fakultas biologi dan dosen dari berbagai peminatan biologi sebagai narasumber. Acara ini diadakan pada hari Senin, 22 April 2024 s/d Kamis, 25 April 2024 pukul 13.00 – 15.00 di Ruang 1, 2, dan 3 (sesuai pembagian jadwal) Lobby 1 Gedung B Sinarmas Fakultas Biologi UGM. Kegiatan BIOENTRI 2024 ini dipandu oleh MC yaitu Alifiansyah Sutama. Kegiatan ini dimulai dengan pembukaan dan doa, lalu dilanjutkan dengan menyanyikan lagu Indonesia Raya, Hymne Gadjah Mada, serta Mars Fakultas Biologi secara bersama-sama. Kegiatan dilanjutkan merupakan sambutan dari Prof. Dr. Budi S. Daryono, M.Agr.Sc. selaku Dekan Fakultas Biologi UGM dan dilanjutkan dengan sesi dokumentasi bersama. Acara selanjutnya yaitu kegiatan presentasi masing-masing dosen pembimbing skripsi ataupun tesis.

Open House Fakultas Biologi UGM tidak hanya bertujuan untuk memperkenalkan beragam topik penelitian yang relevan dengan perkembangan ilmu pengetahuan, tetapi juga berkontribusi langsung terhadap pencapaian Sustainable Development Goals (SDGs) khususnya poin nomor 4 tentang Pendidikan Bermutu (Quality Education). Melalui kegiatan ini, mahasiswa juga dapat memahami bagaimana penelitian yang dilakukan oleh para dosen fakultas ini memberikan dampak positif dalam mencapai berbagai target SDGs lainnya, seperti perlindungan biodiversitas, pemulihan ekosistem (13,14,15), dan peningkatan kesejahteraan masyarakat melalui inovasi di bidang bioteknologi dan pengelolaan sumber daya alam (9, 11, 13).

Penelitian mengenai keanekaragaman hayati dan status konservasi biota perairan umum termasuk ikan dan krustasea, khususnya biota perairan gambut di Kalimantan Timur, masih kurang terdata dengan baik. Terkait hal tersebut, maka teman-teman dari Yayasan Konservasi Alam Nusantara (YKAN) merencanakan kegiatan penelitian biota air tawar di Danau Siran yang terletak di Desa Muara Siran, Kecamatan Muara Kaman, Kutai Kartanegara, Kalimantan Timur. Penelitian tersebut melibatkan beberapa dosen, mahassiwa dan alumni dari Fakultas Biologi UGM. Dosen yang terlibat dari Laboratorium Sistematika Hewan, yaitu: Donan Satria Yudha, S.Si., M.Sc., dan Rury Eprilurahman, S.Si., M.Sc. Sementara itu mahasiswa yang terlibat adalah Muhamad Afnisa’a Rozaqi (mahasiswa program sarjana) dan Maula Haqul Dafa, S.Pd. (mahasiswa program pascasarjana) serta Hastin Ambar Asti, S.Si., M.Sc. (alumni S1 Fakultas Biologi UGM) dan dibantu oleh Pak Susilo Irwanjasmoro (Yayasan Wagleri). Staf YKAN yang turut terjun sampling di lapangan adalah Eka Cahyaningrum, S.Si. (alumni S1 Fakultas Biologi UGM dan posisi di YKAN sebagai Biodiversity and High Conservation Value Specialist) dan Mohamad Arif Rifqi, S.Si. (Posisi di YKAN sebagai Endangered Species Conservation Specialist).

Kegiatan ini dilakukan karena lanskap Muara Siran sejauh ini merupakan ekosistem lahan gambut terbesar di Kalimantan Timur. Lanskap tersebut meliputi sekitar 30.000 hektar dan menyediakan mata pencaharian bagi masyarakat sekitar serta habitat bagi banyak spesies endemik. Namun, Muara Siran terancam oleh praktik pertanian dan pemanenan biota perairan yang tidak berkelanjutan. Terkait hal tersebut, untuk mendukung pembentukan rencana aksi konservasi perairan di Desa Muara Siran, perlu dilakukan survei keanekaragaman hayati biota perairan tersebut guna memahami peran biota air tawar terhadap kebutuhan ekonomi masyarakat.

Penelitian dilakukan selama 6 hari di lanskap Muara Siran, mulai dari Sungai Kani yang merupakan air gambut sehingga disebut air hitam ke Danau Siran hingga ke Sungai Siran. Sampling biota air tawar dilakukan dua kali sehari, yaitu pagi hari dan malam hari. Data biota air tawar kami dapatkan dengan dua cara, yaitu: sampling langsung menggunakan perangkap, mencatat jenis-jenis biota air tawar yang ditangkap dan atau tertangkap oleh jala maupun perangkap nelayan, serta jenis-jenis ikan dari pasar ikan di Kecamatan Muara Kaman. Data yang didapatkan adalah 56 spesies ikan, 3 spesies udang, 1 spesies kepiting, 2 spesies ular air, 1 spesies ular sanca dan 1 spesies biawak air. Hasil kegiatan ini masih perlu dilakukan analisis lanjutan guna mengetahui keanekaragaman hayati biota perairan tawar serta memahami jenis ikan dan krustasea yang penting secara komersial dan jumlah tangkapan untuk nilai ekonomi jenis tersebut.

Yogyakarta, 30 November 2023 – Research Days tahun 2023 sukses dilaksanakan dengan melibatkan puluhan judul penelitian, publikasi, dan pengabdian kepada masyarakat serta produk hilirisasi civitas akademika Fakultas Biologi UGM. Agenda tahunan Fakultas Biologi UGM tersebut ditutup oleh Dr. Eko Agus Suyono, M.App.Sc. selaku Wakil Dekan Bidang Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat, Kerja Sama dan Alumni bertempat di Selasar Gedung B Fakultas Biologi.

Research Days terselenggara selama 2 hari, 29 dan 30 November 2023 dalam bentuk pameran poster hasil penelitian, publikasi, pengabdian kepada masyarakat, dan produk hilirisasi kolaborasi dosen dan mahasiswa Fakultas Biologi. Kegiatan ini sekaligus menjadi wadah sharing dosen dan mahasiswa untuk peningkatan kolaborasi dan kemitraan. Selama dua hari pameran, pengunjung dapat berpartisipasi memberikan suara untuk poster terbaik pilihannya. Produk hilirisasi yang dipamerkan dan dijual turut mengundang apresiasi pengunjung diantaranya terrarium, produk penelitian mikroalga, bibit kultur anggrek, dan sebagainya.

“Melalui Research Days ini diharapkan muncul ide-ide dan kolaborasi baru antar mahasiswa juga dosen,” tukas Dr. Eko dalam sambutannya pada penutupan Research Days 2023, Kamis (30/11) sore. Beliau juga menambahkan apresasinya kepada para mahasiswa yang antusias selama Research Days dengan komentar-komentar ketertarikan mahasiswa dengan penelitian di Fakultas Biologi yang amat beragam.

Di akhir acara, pemenang poster terbaik kategori Poster Penelitian dan Poster Pengabdian kepada Masyarakat turut diumumkan. Pada kategori poster, juara 1, 2, dan 3 berturut-turut diraih oleh poster Prof. Dr. Kumala Dewi M.Sc.St., Dr.med.vet. drh. Hendry T.S.S.G. Saragih, M.P., dan Dr. Ardaning Nuriliani, S.Si., M.Kes. sementara untuk kategori Pengabdian kepada Masyarakat diraih oleh Laksmindra Fitria, S.Si., M.Si., Dwi Umi Siswanti, S.Si., M.Sc., dan Dr. Dwi Sendi Priyono, S.Si., M.Si. Dr. Eko selaku Wakil Dekan Bidang Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat, Kerja Sama, dan Alumni memberikan apresiasi hadiah kepada para pemenang.

Research Days diharapkan dapat menjadi pemicu semangat civitas akademika Fakultas Biologi dalam peningkatan riset, publikasi hingga kegiatan pengabdian kepada masyarakat, sesuai dengan komitmen dukungan terharap Tujuan Pembangunan Berkelanjutan (Sustainable Development Goals; SDGs) terutama dalam peningkatan pendidikan yang inklusif (SDG 4) melalui kolaborasi (SDG 17) yang berkelanjutan. Sampai jumpa di Research Days 2024!

Mikroalga merupakan salah satu tanaman air yang memiliki banyak manfaat. Umumnya mikroalga digunakan sebagai bahan tambahan pakan dalam budidaya akuakultur karena dapat berperan dalam penambahan berat badan dan peningkatan ketahanan terhadap penyakit pada ikan. Topik inilah yang diusung oleh tim MBKM Penelitian Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada yang beranggotakan Dimas Anggoro Putranto, Hardian Ridho Alfalah, dan Rahmi Ramadhani Putri.

Pada proyek riset ini, diusung judul “Studi In silico Potensi Mikroalga sebagai Sumber Pakan Immunostimulan pada Ikan Sidat”. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi mikroalga Chlorella sp, Nannochloropsis sp, dan Spirulina sp. Kegiatan MBKM penelitian ini berkolaborasi dengan INBIO dalam rangka mengembangkan inovasi dan meningkatkan kemampuan mahasiswa di bidang bioinformatika dan biomolekuler. INBIO (Indonesia Bioinformatics and Biomolecular) merupakan lembaga yang bergerak dalam bidang layanan analisa bioinformatika dan biomolekuler di Indonesia. Selain melakukan penelitian, para mahasiswa juga berkesempatan menjadi intern di Inbio selama satu tahun.

Selama kegiatan MBKM, para mahasiswa melakukan identifikasi mikroalga dan ekstraksi dengan metode maserasi yang akan digunakan untuk analisis kandungan fitokimia dengan GC-MS. Selanjutnya mahasiswa melakukan pencarian protein target di PDB dan pencarian Ligan di pubchem. Mahasiswa juga melakukan preparasi protein dan ligan, serta dilanjutkan dengan proses docking, visualisasi interaksi, dan analisis data.

Menurut Nur Indah Septriani, S.Si., M.Sc., Ph.D. selaku dosen pembimbing, kegiatan ini merupakan langkah awal dalam penelitian lebih lanjut terhadap potensi mikroalga sebagai sumber pakan immunostimulan pada ikan sidat. Dengan penelitian ini, diharapkan dapat menciptakan inovasi yang bermanfaat bagi masyarakat. “Melalui program MBKM penelitian ini diharapkan mahasiswa dapat memperluas wawasannya tidak hanya di dalam kampus namun juga diluar kampus (institusi institusi terkait) sehingga tercipta suasana pendidikan yang inklusif, dapat dinikmati siapapun darimana pun salnya. Hal ini selaras dengan SDGs nomor 4, yaitu meningkatkan kualitas pendidikan,” ujar Bu Indah.

Plastik sudah menjadi sebuah bagian tidak terpisahkan dalam kehidupan manusia modern, mulai dari pakaian, kemasa makanan, peralatan rumah tangga, hingga bahan bangunan. Dibalik segala manfaatnya plastik juga menjadi ancaman besar terhadap kelangsungan kehidupan di bumi dengan lebih dari 10 juta ton limbah plastik dilepaskan ke lingkungan dan lautan bebas. Berbagai usaha untuk menangani masalah tersebut pun terus dilakukan salah satunya mencari pengganti plastik konvensional yang lebih ramah lingkungan dan sustainable. Salah satu kandidat pengantinya adalah PHB atau polihidroksibutirat yang merupakan sebuah biopolimer yang ditemukan secara alami dalam tubuh berbagai jenis mikroorganisme, dipercaya akan menjadi polimer utama bahan dasar plastik di masa depan menggantikan plastik konvensional yang berbahan dasar minyak bumi karena sifatnya yang  biobased, biosynthesised, dan biodegredable (bahkan dalam lingkungan alami).

Melihat tantangan sekaligus peluang ini 3 mahasiswa Fakultas Biologi UGM yaitu Azizah Tyas Nugrahanty, Bagas Alfian Dwiaryanda, dan Lucia Arum Sekar Meysari melaksanakan Program Merdeka Belajar-Kampus Merdeka (MBKM) yang fokus dalam mengembangkan organisme produser PHB yang efektif dan efisien dengan memanfaatkan teknologi transformasi genetik. Pelaksanakan program MBKM ini dilakukan dibawah bimbingan Ibu Ganies Riza Aristya, S.Si., M.Sc., Ph.D. dari Fakultas Biologi, UGM dan bekerjasama dengan Raden Afif Pranaya Jati, S.P., M.Sc., praktisi dari Institut Bioinformatika Indonesia (INBIO-Indonesia).

Sepanjang penelitian mahasiswa melakukan berbagai kegiatan dari yang bersifat dry lab hingga wet lab. Penelitian diawali dengan diskusi terkait pemilihan vektor dan host mikroorganisme yang akan digunakan. Kemudian, dilakukan desain plasmid vektor transformasi genetik hingga pembuatan primer yang akan digunakan sebagai marker penanda koloni positif melalui colony pcr. Penelitian kemudian dilanjutkan ke tahap wet lab di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan UGM, mulai dari preparasi kompeten sel, transformasi genetik dengan metode elektroporasi, PCR koloni yang diikuti elektroforesis untuk mengkonfirmasi koloni positif membawa gen target. Sampai saat ini, tim telah berhasil mengkombinasikan gen sintetik hasil konstruksi plasmid kedalam sel bakteria sebagai kandidat untuk mikrobia penghasil PHB secar alami.