Fakultas Biologi UGM merupakan fakultas yang terus melaju dalam melakukan riset genomik dan bioinformatik. Salah satu dosen di fakultas ini, Dr. Niken Satuti Nur Handayani, M.Sc. mendapat kesempatan untuk mengikuti The Asia-Pasific (APAC) Population-Genomics, Informatics, and Interpretation Workshop 2023 di Thailand. Diselenggarakan oleh Oxford Nanopore Technology, workshop dilaksanakan di Thailand Science Park Convention Center, The National Science and Technology Development Agency (NSTDA), Rangsit, Bangkok, Thailand, pada tanggal 15-16 Maret 2023. Dipimpin langsung oleh Ketua Yayasan Satriabudi Dharma Setia (YSDS), yaitu dr. Vincentius S.W Budhyanto, Dr. Niken, bersama-sama dengan Peneliti Genomik dari Universitas Airlangga, Institut Teknologi Del, Universitas YARSI, Institut Teknologi Bandung, dan RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo, berangkat ke Thailand dengan dukungan penuh dari YSDS.
Workshop yang mengundang ilmuwan dan peneliti genomik di Asia-Pasifik tersebut memberikan kesempatan yang sangat baik untuk memahami permasalahan sekuensing long-read genom manusia dengan Oxford Nanopore Technology (ONT) dan bagaimana mengatasi berbagai permasalahan; memahami struktur data ONT dan perbedaannya dari analisis short reads; dan menyiapkan alur kerja untuk analisis variasi genom manusia, termasuk di dalamnya adalah analisis Single Nucleotide Variant (SNV)/indels, Copy Number Variations (CNV) dan Short Tandem Repeat (STR). Selain itu, peserta workshop mendapat kesempatan mendengarkan presentasi NIVDIA, perusahaan teknologi multinasional Amerika, tentang dukungan mereka untuk studi genomik skala besar. Pada hari ke-2, peserta workshop diajak berkeliling di Innovation Cluster NSTDA, salah satunya mengunjungi NSTDA Supercomputer Center (ThaiSC) dan melihat Supercomputer LANTA System.
Kesempatan penting di akhir kegiatan adalah berdiskusi dan mendapatkan manfaat dari pengalaman tim bioinformatika dari beberapa institusi di Asia-Pasific untuk nantinya dapat berkontribusi bersama pada kemajuan penelitian genomik di Indonesia.
Keikutsertaan Dr. Niken Satuti Nur Handayani, M.Sc. dalam Asia-Pasific (APAC) Bioinformatics Workshop ini menunjang pelaksanaan Sustainable Development Goals (SDGs) dalam memahami permasalahan-permasalahan yang muncul pada sekuensing Long-read genom manusia dengan Oxford Nanopore Technology (ONT), termasuk bagaimana penyelesaian masalah tersebut, untuk peningkatan kualitas pendidikan (SDGs 4) di Indonesia, khususnya di Fakultas Biologi UGM. Selain itu, pelaksanaan kegiatan workshop ini juga sejalan dengan Sustainable Development Goals (SDGs) No. 9 tentang adanya inovasi studi genomik skala besar.
