Kelompok studi mikroalgae, di bawah Laboratorium Bioteknologi, Fakultas Biologi, Universitas Gadjah Mada, telah sukses menggelar Workshop Bioinformatika bertajuk “Bionformatics Approaches to Genomic Research: RNA-Seq and Genome Sequencing”, yang dilaksanakan pada tanggal Tanggal 10 Desember 2024 hingga 13 Desember 2024. Workshop tersebut diikuti oleh 17 peserta yang berasal dari berbagai kalangan, mulai dari dosen, mahasiswa, hingga profesional. Adapun materi pada workshop tersebut disampaikan langsung oleh Afif Pranaya Jati, S.P., M.Sc, mahasiswa S3, Department Mikrobiologi, Monash University, Australia.
Workshop tersebut bertujuan untuk memberikan pemahaman tentang penggunaan teknik-teknik bioinformatika dalam menganalisis data genomik dan transkriptomik. Pada workshop tersebut, para peserta diharapkan dapat mempelajari cara-cara terbaru dalam menganalisis data RNA-Seq, sekuensing genom, gene mining, hingga praktek penggunaan perangkat lunak dalam analisis bioinformatika.
Pembukaan Workshop tersebut dilakukan pada hari Jumat (10 Desember 2024), dibuka langsung oleh kepala Departemen Biologi Tropika Abdul Razaq Chasani, S.Si., M.Si., Ph.D. di Auditorium Biologi Tropika, Fakulas Biologi, Universitas Gadjah Mada. Pada hari pertama, topik yang disampaikan fokus pada teori-teori yang menyangkut teknik sampling dan QC sequencing yang disampaikan oleh pemateri utama. Selain itu, materi juga disampaikan oleh Matin Nuhamuda, S.Si., M.Sc., Ph.D., Dosen Laboratorium Bioteknologi, Fakultas Biologi, UGM., secara daring, dengan tema Genome Mining-From Data to Insight.
Hands-on dilaksanakan mulai dari hari ke-2 hingga hari terakhir, di gedung MSIBC, Fakultas Biologi, Universitas Gadjah Mada. Pada hari kedua, materi yang disampaikan yaitu Introducing sequencing to metagenomics. Materi hari ke-tiga yang disampaikan berkaitan mengenai Introducing whole genome sequencing (WGS) and how to interpret the data. Sedangkan, pada hari terakhir, materi yang dibahas yaitu berkaitan dengan RNA sequencing dan interpretasi datanya. Hands-on tersebut dilakukan menggunakan data yang diperoleh dari NCBI maupun interpretasi data peserta secara langsung. Hands-on dilakukan dengan menggunakan website Galaxy EU, platform analisis data bioinformatik berbasis website yang berasal dari Eropa yang dapat diakses secara gratis.
Adapun penutupan workshop tersebut kembali dihadiri oleh Prof. Endang Semiarti dan Dr. Eng. Thoriq Teja Samudra. Pada penutupan tersebut, Prof. Endang menuturkan bahwa workhsop tersebut sangat penting dalam meningkatkan kemampuan analisis bioinformatik yang saat ini sangat diperlukan. Beliau berharap kegiatan serupa dapat dilanjutkan kedepannya.
Melalui workshop ini, diharapkan pula para peserta dapat memperluas pengetahuan penelitian genomik di berbagai macam bidang, seperti kesehatan, pertanian, bioteknologi, dan lain sebagainya. Pelaksanaan workshop tersebut sesuai dengan SDGs nomor 4 mengenai Quality Education, guna menghasilkan sumber daya manusia yang unggul melalui pendidikan. Serta, suatu approach untuk mengkaji biodiversitas makhluk hidup, baik life below water (SDGs nomor 14), dan Life on Land (SDGs nomor 15).
Penulis: Angga Puja Asiandu
